立命館大学計算生物学研究室

計算生物学研究室では、観測データに基づく逆問題として生命現象を捉え、生命科学データに含まれる構造的なパターンや時間的一貫性を手がかりとして、観測データからは直接得られない内部状態や関係構造を推定する研究に取り組んでいます。

顕微鏡画像の定量化によって得られる時系列データを解析し、細胞状態の変化や異常の検知、要素間の因果関係を明らかにすることを目指しています。

対象としているのは、線虫胚発生過程、マウス脳画像、大腸菌の代謝・増殖データなどです。これらの高次元データを活用し、生命システムの理解に向けた情報処理技術の開発を進めています。

本研究室では、以下の観点から生命データ解析に取り組んでいます。

少量データや撮影条件の変動に頑健な深層学習技術・画像処理技術を開発し、観測データから空間構造（形態・領域）を抽出します。

正常構造からの逸脱として異常を捉え、微小な状態変化や異常現象を検出します。

時系列データと数理モデルを用いて、要素間の関係や状態遷移を推定します。

情報科学と生命科学の融合領域に関心をもち、深層学習・機械学習・数理モデルを用いて、生命データから状態や構造を推定する研究に取り組みたい学生を歓迎します。